玉米種子的儲藏環境，直接影響種子的生命力。為確保其安全儲藏，必須采用科學的管理方法。
（1）做好種倉的清理和消毒。種子入倉前，對倉庫及倉具要進行清理、消毒。對麻袋、編織袋、篩子等器具，可采用刮、敲、打、洗、曝曬和開水燙等方法進行清理。對倉內的異品種種子、雜質和垃圾要清除。要刮去蟲窩，修補墻面。同時做好倉外的清理工作。
倉庫消毒可用80%敵敵畏乳油100～200毫克/平方米進行噴霧或掛條施藥，然后密封72小時。消毒后須通風24小時方可進庫。也可用0.5%～1%的敵百蟲溶液均勻噴灑，每100平方米噴施3千克藥液。
（2）把好種子入庫關。種子入庫時，種子的品質、種子成熟度和破碎粒率應符合規定標準。同時要求種子含水量不能超過13%。要做到“五分開”，即：級別不同的種子要分開；干、濕種子要分開；受潮和不受潮的種子要分開；新、陳種子要分開；有蟲病和無蟲病的種子要分開。
（3）加強倉庫通風。在倉庫溫度較高，或種子含水量較大時，要及時通風。種子通風時間應在9∶00～10∶00或18∶00～19∶00，中午不要通風。通風要掌握4個要領，即晴通、雨閉、雪不通；滴水成冰可以通；早通、晚通、午不通；夜間有霧不能通。
（4）勤于種子檢查。一查種溫。注意根據種子含水量等及時檢查種溫。檢查應選晴天，在上午9∶00～10∶00進行。散裝倉分上、中、下3層抽樣，每層檢查5點共15處；袋裝堆放種子的檢查，也應定層、定點，可分為上、中、下層檢查。
二查水分。以25平方米為1個檢驗區，采用3層5點共15處的抽樣方法。檢查的間隔時間，在第一、四季度每月檢查1次長期儲藏的種子，第二、三季度每月檢查2次。
三查發芽率。短期儲藏的種子一般不檢查發芽率，長期儲藏的種子應每4個月檢查1次發芽率。另外，根據氣溫的變化及在熏蒸前后也要相應進行檢查。最后1次檢驗應在出庫前10天進行。
