軋花后的皮棉不能散放，必須經打包機打成符合國家標準的棉包。國家標準皮棉包裝有三種包型：85公斤/包（±5公斤）、200公斤/包（±10公斤）、 227公斤/包（±10公斤），目前我國棉包絕大部分為85公斤。棉花一般存放在專業的棉花儲備庫內，目前國內的棉花儲備庫房有磚混倉和鋼板倉兩種。儲存庫要求交通便利、防火、通風、防潮、防霉變等，特別是防火，棉花儲備庫都是特級防火單位。一般來說棉花應庫內堆垛存放，庫外存放要蓋苫布。棉垛下要打好墊基（枕木或石塊），堆垛時包應平放，上下層交叉壓縫。垛與垛之間應留出必要的通道。棉花庫區要設立氣象觀測百葉箱，每棟庫房都要配備溫濕度計。保管員應每天查庫，測量溫濕度，并做好記錄。根據天氣的變化和庫內外溫濕度差異，應適時采取通風散濕或關閉倉庫等措施。一般庫內溫度應保持在30℃以下，最高不得超過35℃，相對濕度不得超過70％，保管中的棉花含水率不得超過10％。
