1.耐藏性好
成熟后的棉籽，種皮結構致密而堅硬，外有蠟質層可防外界溫、濕度的影響。種皮內含有約7．6％左右的鞣酸物質，具有一定的抗菌作用。所以，從生物學角度講，棉籽屬于長壽命種子。一般從霜前花軋出的棉籽比霜后花軋出的棉籽，耐藏性好。
2.通氣性差、導熱性差
一般的棉籽表面的短絨，約占種子重量的55％左右，它的導熱性較差，具有相當好的保溫能力，不易受外界溫、濕度的影響。如果棉籽堆內溫度較低時，則能延長低溫時間，相反堆內的熱量也不易向外散發，如果水分和溫度較高，短絨易吸附水分子，還易孽生霉菌，就會使棉花種子的呼吸作用加強，不僅消牦養分，而且還產生水分和放出熱量，熱量積累在棉籽堆內而不能散發，導致種子堆發熱霉變，
3.含油分多，易酸敗
棉籽的脂肪含量較高，約在20％左右，其中不飽和脂肪酸含量比較高，易受高溫、高濕的影響使脂肪酸敗。特別是霜后花中軋出的種子，更易酸敗而喪失生活力。
成熟后的棉籽，種皮結構致密而堅硬，外有蠟質層可防外界溫、濕度的影響。種皮內含有約7．6％左右的鞣酸物質，具有一定的抗菌作用。所以，從生物學角度講，棉籽屬于長壽命種子。一般從霜前花軋出的棉籽比霜后花軋出的棉籽，耐藏性好。
2.通氣性差、導熱性差
一般的棉籽表面的短絨，約占種子重量的55％左右，它的導熱性較差，具有相當好的保溫能力，不易受外界溫、濕度的影響。如果棉籽堆內溫度較低時，則能延長低溫時間，相反堆內的熱量也不易向外散發，如果水分和溫度較高，短絨易吸附水分子，還易孽生霉菌，就會使棉花種子的呼吸作用加強，不僅消牦養分，而且還產生水分和放出熱量，熱量積累在棉籽堆內而不能散發，導致種子堆發熱霉變，
3.含油分多，易酸敗
棉籽的脂肪含量較高，約在20％左右，其中不飽和脂肪酸含量比較高，易受高溫、高濕的影響使脂肪酸敗。特別是霜后花中軋出的種子，更易酸敗而喪失生活力。
