種肥同播因肥料施用相對集中，肥料距種子或作物根系較近，假如所選肥料不合理，極有可能出現農民擔心的“燒苗”。
現實生產中，種肥同播所用肥料可選用復合肥、二銨或尿素。選用復合肥時，盡量不要選用尿基復合肥，因尿基復合肥含有的縮二脲不利于種子發芽，容易引發燒苗。應盡量選用硝基復合肥，比如撒可富玉米肥（硝基），也可選擇緩控釋肥。緩控釋肥主要是“控氮”，一般采用的都是包膜技術，這樣可避免因尿素過量引發的“燒苗”。二銨盡量選擇大廠生產的，或者選用具有一定功能性的二銨。尿素的選擇應更加謹慎，因為無論顆粒大小，尿素都不可避免地含有一定量的縮二脲，而且當溫度、濕度較大時，尿素分解速度很快，分解揮發出的氨氣也會妨礙作物發芽，對根系產生不良影響。建議選用具有緩釋功能的包膜尿素，或選用具有明顯抑制氨揮發功能的鋅腐酸尿素。需要適當控制尿素的用量，同時適當加大種肥隔離的距離。
