棉花的合理施肥就是依據氣候條件，棉田地力，棉花需肥規律及棉花需肥規律及棉花長相長勢，合理運籌肥料，起到培肥地力，促使棉花個體發育和群體發育，營養器官發育和生殖器官發育協調一致，達到棉花生產的優質，高產高效益的目的。
施肥化學肥料是以供給棉花養分為目的，而施用微生物肥料除向棉花提供養分外，重要的是增加根層土壤有益微生物菌群，改善土壤微生物區系，增加水穩性團粒，調整三項比例等土壤物理性狀及生物、化學性狀從而達到提高土壤肥力的目的。因此，有機、無機相結合，既能獲得棉花高產，又能改善土壤，提高肥力。
棉花施肥分育苗，基肥和追肥。
育苗：華北地區一般采用育苗移植方法。在育苗營養土中可加入微生物菌劑，這樣有利于防病，壯苗。如采用營養缽育苗每500克菌劑可與有機肥營養土等拌勻，裝入300營養缽中。其它管理與常規育苗相同。
基肥在有一定保肥能力的棉田。復合微生物肥料（含N：P：K為5：5：5）每畝施用50kg。定植前使用，追肥在棉花作花鈴期每畝40——50kg。在土壤肥力較差，質地偏砂的棉田應增加施肥量。此外在棉田有效鋅含量0.2mg/kg應補充鋅和硼肥,可用硫酸鋅1~2kg/畝.硼砂0.5--1kg每畝.也可采用在葉面噴施在蕾期,初花期和花鈴期進行。
施肥化學肥料是以供給棉花養分為目的，而施用微生物肥料除向棉花提供養分外，重要的是增加根層土壤有益微生物菌群，改善土壤微生物區系，增加水穩性團粒，調整三項比例等土壤物理性狀及生物、化學性狀從而達到提高土壤肥力的目的。因此，有機、無機相結合，既能獲得棉花高產，又能改善土壤，提高肥力。
棉花施肥分育苗，基肥和追肥。
育苗：華北地區一般采用育苗移植方法。在育苗營養土中可加入微生物菌劑，這樣有利于防病，壯苗。如采用營養缽育苗每500克菌劑可與有機肥營養土等拌勻，裝入300營養缽中。其它管理與常規育苗相同。
基肥在有一定保肥能力的棉田。復合微生物肥料（含N：P：K為5：5：5）每畝施用50kg。定植前使用，追肥在棉花作花鈴期每畝40——50kg。在土壤肥力較差，質地偏砂的棉田應增加施肥量。此外在棉田有效鋅含量0.2mg/kg應補充鋅和硼肥,可用硫酸鋅1~2kg/畝.硼砂0.5--1kg每畝.也可采用在葉面噴施在蕾期,初花期和花鈴期進行。
