對大面積條紋葉枯病抗性較弱或沒有抗性的水稻品種而言，防病重點在于避免或減少灰飛虱傳毒。麥收前后是一代灰飛虱由麥田向水稻秧田大量遷移并傳毒的高峰期。在生產允許的情況下，可以適期推遲播種，結合使用拋栽、肥床旱育等輕型栽培措施，將播種期推遲至５月１５日左右甚至更遲，以后采用中苗移栽或小苗拋栽的辦法。這樣能有效避開一代灰飛虱遷飛傳毒高峰。另外，盡量選擇蟲源量少、周圍環境清潔的田塊作秧田。有條件的可將秧池集中連片，避免在麥田田頭一家一戶孤立育秧。藥劑浸種對苗床早期帶毒灰飛虱有一定的防治效果，每公斤稻種用吡蟲啉０．８克以上（有效成分），也可以用銳勁特浸種。藥劑浸種還能兼治秧田期螟蟲等其他害蟲。在水稻秧田期和移栽大田前期，抓住灰飛虱傳毒高峰期適時用藥防治灰飛虱。銳勁特是防治灰飛虱的首選藥劑，一般每畝用５％銳勁特３０毫升，可兼治三化螟、稻薊馬。每畝用１０％吡蟲啉４０克或５％高效大功臣可濕性粉劑２０克，對灰飛虱也有很好的防治效果。生產上應有組織地在較大的區域內對灰飛虱進行統防統治，以取得最佳的治蟲控病效果。
在水稻條紋葉枯病重發區，應盡量選用抗耐病水稻品種，如泗稻１０號、鹽粳５號、鹽粳６號、鹽粳７號、鹽稻８號、淮稻６號、淮優粳２號、徐稻３號、鎮稻８８、鎮稻９９、揚粳９５３８等，或改種抗性強于粳稻的優質秈稻品種兩優培九、汕優５５９等。
在水稻條紋葉枯病重發區，應盡量選用抗耐病水稻品種，如泗稻１０號、鹽粳５號、鹽粳６號、鹽粳７號、鹽稻８號、淮稻６號、淮優粳２號、徐稻３號、鎮稻８８、鎮稻９９、揚粳９５３８等，或改種抗性強于粳稻的優質秈稻品種兩優培九、汕優５５９等。
