近年來，畜禽水產中違規使用抗生素、禁用化合物及獸藥殘留超標問題時有發生，為保障畜禽水產品質量安全，維護群眾身體健康，國務院食品安全辦、工業和信息化部、農業部、國家衛生計生委、食品藥品監管總局決定自2016年8月—2017年12月，在全國范圍內集中開展畜禽水產品抗生素、禁用化合物及獸藥殘留超標專項整治行動。對于孔雀石綠等具有抗生素功能的禁用化合物需實名購買。
嚴打產銷禁用獸藥行為
專項整治行動中，整頓規范獸用化學藥品生產經營主體，摸清獸用抗生素生產經營情況，嚴厲打擊生產、銷售硝基呋喃等禁用獸藥的行為，對于孔雀石綠等具有抗生素功能的禁用化合物，要建立實名購買和流向登記制度，實施嚴格管控。
在整治規范獸藥使用行為方面，嚴格管控抗菌藥類藥物飼料添加劑；嚴厲打擊超劑量超范圍用藥、違規使用原料藥、不執行休藥期、不按獸用處方藥規定使用處方藥、濫用抗菌藥物等違法行為。在水產品養殖環節開展以“大菱鲆、烏鱧、鱖魚”（三魚）和“孔雀石綠、硝基呋喃”（兩藥）為重點的水產品集中治理，“三魚”主產區和“兩藥”違規使用多發區要有針對性地制定“三魚兩藥”專項整治行動方案，加大執法檢查和監督抽檢力度，嚴厲打擊違法用藥行為。
完善畜禽水產品追溯制度
摸清網上銷售獸藥特別是抗生素的基本情況，調查、收集、整理、匯總假冒獸藥企業、發布假獸藥信息、無證經營等違法違規形式的網站或第三方交易平臺，經核實確認為非法的，依法予以處置。嚴厲打擊利用網絡銷售硝基呋喃等禁用獸藥的行為。
在整治抗生素等獸藥殘留超標問題方面，以畜禽水產品生產運輸環節、市場銷售及餐飲環節監督抽檢為抓手，擴大對畜禽水產品中抗生素等獸藥抽樣覆蓋范圍，增加風險隱患品種抽檢數量和頻率，切實掌握畜禽水產品質量安全狀況。健全完善畜禽水產品追溯管理制度，發現獸藥殘留超標等問題樣品，要實施來源追溯和去向追蹤。
