各類農作物的子粒都有一個最佳的遺傳部位，生長在這一部位上的種子種性優良，不易退化，播后苗壯，能提高產量。
 
　　甜瓜和其他作物一樣，也具有自身的最佳遺傳優勢部位。甜瓜由于品種不同，整枝方式也不同，但在選擇最佳的遺傳優勢部位時，無論是三蔓還是四蔓式整枝，都以留主蔓的第二個瓜做種為好，側蔓上瓜的遺傳優勢比不上主蔓上的瓜。實踐證明，甜瓜主蔓上第二個瓜的種子，其發芽率可達100%。