金針菇叢枝病是一種非傳染性的生理病害。其癥狀為：當栽培菌袋或菌瓶由菌絲生長轉到子實體形成階段時，出現茹蕾叢生，只長菌柄不形成菌蓋，菌柄伸長到一定長度時，頂端產生分枝，小分枝生長一定時間后又產生分枝，小分枝越長越細弱并下垂，形成一叢似披發狀的菌叢，完全不像正常生長的子實體菌柄向上生長，頂端膨大后形成菌蓋。
病原：由CO2濃度過高和濕度過大所引起。袋栽或瓶栽金針菇當菌絲生長到一定階段轉向子實體形成時，即原基出現后，應保持適當通風和給予一定的光線刺激，并降低菇房的溫度，這時期如果在瓶、袋口內外的CO2氣體濃度積累過高，氧氣不足和缺乏弱光刺激，加上濕度過高，導致子實體畸形生長，只長菌柄不形成菌蓋，并在頂端不斷產生分枝。
病原：由CO2濃度過高和濕度過大所引起。袋栽或瓶栽金針菇當菌絲生長到一定階段轉向子實體形成時，即原基出現后，應保持適當通風和給予一定的光線刺激，并降低菇房的溫度，這時期如果在瓶、袋口內外的CO2氣體濃度積累過高，氧氣不足和缺乏弱光刺激，加上濕度過高，導致子實體畸形生長，只長菌柄不形成菌蓋，并在頂端不斷產生分枝。
