枸杞樹經過一年的生長，枝杈繁多，樹冠凌亂，而且在新果枝形成的同時，一部分結果枝已經開始衰老。因此，冬季必須對枸杞進行修剪，否則將影響翌年的產量和品質。通過修剪，去舊換新，選留結果力強的老眼枝和七寸枝，剪除非生產性的枝條，可為翌年老眼枝結果和生長出新的結果枝打下良好基礎。剪頂為了管理方便，需要通過剪頂控制樹體高度。一般樹體高度應控制在１－８米。樹冠上部有空間的部位要短截徒長枝，保留２０厘米左右枝樁，以利發枝，補充樹冠。沒有保留價值的徒長性枝條要從基部剪掉。截底為了便于枸杞園的土壤管理，不使下垂枝上的果子霉爛，應對樹冠基層著地的枝條在距地高３０厘米處短截。清膛樹冠內部的細弱枝要去掉，密擠枝適當疏剪，以保持良好的通風透光條件，利于果實生長發育。修圍就是對樹冠結果枝層的修剪。主要是選留良好的結果枝，剪除結果枝層的老枝、針刺枝、病蟲枝、風折枝、交叉枝、重疊枝和密擠枝。修剪時要根據新果枝的多少來決定老枝的取舍。若新枝多，老枝可以回縮到健壯分枝處。冬季修剪宜輕不宜重，不要短截太多。因為枝條頂端１６－５０厘米處是翌年結果最早的芽眼，結果枝短截太多，直接影響翌年春果的產量。為做到不漏剪，應從上到下，圍繞樹冠順一個方向精細修剪。
