不要選病蟲害嚴重的棉株對干枯、黃萎病的棉株和抗蟲性不好的棉株一定要淘汰(而在重病地表現良好的棉株則可以留種)。
不要選伏前桃和晚秋桃伏前桃和晚秋桃生長發育不良，成熟度差，鈴重輕，種子發芽率低，長勢弱，不宜選用。
不要用“剝桃花”的棉籽有些棉農對發育較為充分的伏桃，仍然有“剝裂嘴桃、摘濕花”的陋習，由于其沒有充分成熟，絕對不能留種。
不要用噴乙烯利的棉籽噴施乙烯利雖可促棉花早熟5～7天，但對棉籽損傷較大，致使其發育不全，不能做種。
不要用退化嚴重的品種棉花是常異花授粉作物，異交率在3%～20%，抗蟲棉品種在經過幾年的連續繁殖過程中，如果不加以提純復壯，常因昆蟲傳粉而造成生物學混雜。對純度不高的地塊應避免留種。
不要選雜交棉品種在當前的科技水平下，雜交棉品種并不完善，且F2代的分離現象十分嚴重，應避免采用。
不要在水泥地面上曬在水泥地面上曬含水量較高的棉籽，會使部分棉籽形成“啞籽”，失去發芽能力。
不要與農藥、化肥一起存放有些農戶將棉籽與農藥、化肥長期存放在一起，由于通氣不良，且農藥、化肥散發的毒氣損傷棉籽正常的生理，造成發芽率銳減。
