種子帶有的病蟲是水稻病蟲感染的最初來源之一。選擇健康的種子或針對種子帶有的主要病蟲種類采取相適應的消毒殺蟲方法，配合土壤處理是減少病蟲來源、推廣無公害栽培的重要途徑。因此對于水稻無公害栽培，在播種前有必要對種子進行“體檢”。
用高錳酸鉀染色法檢查谷象和米象取種子試樣15克，除去雜質，倒入銅絲網中，在30℃水中浸泡1分鐘，再移入1%高錳酸鉀溶液中染色1分鐘。然后用清水洗滌，倒在白色吸水紙上用放大鏡檢查，挑出粒面上帶有直徑0.5毫米的斑點，即可計算害蟲含量。
用比重法檢查其它隱蔽害蟲取種子試樣100克，除去雜質，倒入食鹽飽和溶液中（含鹽35.9克溶于1000毫升水中），攪拌10~15分鐘，靜止1~2分鐘，將懸浮在上層的種子取出，進行解剖檢查：取試樣5克左右，用解剖刀剖開或切開種子的被害部分或可疑部分，檢查害蟲。計算含蟲量。
用吸水紙法檢查稻瘟病取種子試樣400粒，將培養皿內的吸水紙用水濕潤，每個培養皿播25粒種子。在22℃條件下用12小時放黑暗處和12小時近紫外光照的交替周期培養7天。在12~50倍放大鏡下檢查每粒種子上的稻瘟病分生孢子。一般這種真菌會在穎片上產生小而不明顯、灰色至綠色的分生孢子。這種分生孢子成束地著生在短而纖細的分生孢子梗的頂端。菌絲很少覆蓋整粒種子。如有懷疑，可在200倍顯微鏡下檢查分生孢子來核實。
用吸水紙法檢查胡麻斑病取試樣400粒種子，將培養皿里的吸水紙用水濕潤，每個培養皿播25粒種子。在22℃溫度條件下用12小時放黑暗處和12小時近紫外光照交替周期培養7天。在12~50倍的放大鏡下檢查每粒種子的胡麻斑病的分生孢子。在種皮上形成分生孢子梗和淡色氣生菌絲，有時病菌會漫延到吸水紙上。
用種植法檢查細菌性病害即用生長植株進行檢查，在給幼苗或植株一部分進行感染試驗時。應注意植株從其它途徑傳播感染，并控制各種條件。
健康檢查報告用供檢查的樣品重量中感染病蟲的百分率或病原體數目來表明種子健康程度。如感染的百分率高或病原體數目多則表明種子欠健康，反之則種子健康或比較健康。
用高錳酸鉀染色法檢查谷象和米象取種子試樣15克，除去雜質，倒入銅絲網中，在30℃水中浸泡1分鐘，再移入1%高錳酸鉀溶液中染色1分鐘。然后用清水洗滌，倒在白色吸水紙上用放大鏡檢查，挑出粒面上帶有直徑0.5毫米的斑點，即可計算害蟲含量。
用比重法檢查其它隱蔽害蟲取種子試樣100克，除去雜質，倒入食鹽飽和溶液中（含鹽35.9克溶于1000毫升水中），攪拌10~15分鐘，靜止1~2分鐘，將懸浮在上層的種子取出，進行解剖檢查：取試樣5克左右，用解剖刀剖開或切開種子的被害部分或可疑部分，檢查害蟲。計算含蟲量。
用吸水紙法檢查稻瘟病取種子試樣400粒，將培養皿內的吸水紙用水濕潤，每個培養皿播25粒種子。在22℃條件下用12小時放黑暗處和12小時近紫外光照的交替周期培養7天。在12~50倍放大鏡下檢查每粒種子上的稻瘟病分生孢子。一般這種真菌會在穎片上產生小而不明顯、灰色至綠色的分生孢子。這種分生孢子成束地著生在短而纖細的分生孢子梗的頂端。菌絲很少覆蓋整粒種子。如有懷疑，可在200倍顯微鏡下檢查分生孢子來核實。
用吸水紙法檢查胡麻斑病取試樣400粒種子，將培養皿里的吸水紙用水濕潤，每個培養皿播25粒種子。在22℃溫度條件下用12小時放黑暗處和12小時近紫外光照交替周期培養7天。在12~50倍的放大鏡下檢查每粒種子的胡麻斑病的分生孢子。在種皮上形成分生孢子梗和淡色氣生菌絲，有時病菌會漫延到吸水紙上。
用種植法檢查細菌性病害即用生長植株進行檢查，在給幼苗或植株一部分進行感染試驗時。應注意植株從其它途徑傳播感染，并控制各種條件。
健康檢查報告用供檢查的樣品重量中感染病蟲的百分率或病原體數目來表明種子健康程度。如感染的百分率高或病原體數目多則表明種子欠健康，反之則種子健康或比較健康。
