板栗南瓜設施栽培的病蟲害防治首先要選擇抗病性好、品質優良的品種，如臺灣農友公司的一品和東升。
板栗南瓜的主要病害有：白粉病、病毒病、蔓枯病、疫病等。白粉病苗期至收獲期均可發生，可用40%杜邦福星6000～8000倍液、20%粉銹寧乳油1000倍液或50%加瑞農600倍液等噴霧防治。病毒病由蚜蟲、葉甲傳毒，加強田間管理，及時防治蚜蟲、葉甲是預防病毒病的重要方法。發病初期可用20%病毒A500倍液、病毒K1000倍液、病毒靈500倍液噴霧防治，隔7～10天用1次，連續防治3次。蔓枯病可危害葉片、莖蔓和果實，主要的病癥是莖蔓病斑部位有琥珀色樹脂狀膠質物溢出，此病應通過輪作、選用抗病品種、采用配方施肥技術，施用充分腐熟有機肥來預防。發病初期可用40%杜邦福星8000倍液、36%甲基硫菌靈400倍液或47%加瑞農700倍液噴灑。疫病可危害莖、葉、果，染病初為水漬狀，然后軟腐，并在病部生出白色霉狀物。發病初可用72%杜邦克露800倍液、58%甲霜靈錳鋅500倍液、69%安克錳鋅1000倍液噴灑。
板栗南瓜的主要蟲害有：蚜蟲、薊馬、茶黃螨、瓜螟等，蚜蟲和薊馬可選用10%吡蟲啉2000倍液、1%殺蟲素3000倍液或20%康福多4000倍液防治。茶黃螨可選用73%克螨特2000倍液、5%卡死克1000倍液，或1%殺蟲素3000倍液防治。瓜螟可選用5%抑太保1000倍液、或48%樂斯本800倍液，或5%卡死克1000倍液進行防治。
板栗南瓜的主要病害有：白粉病、病毒病、蔓枯病、疫病等。白粉病苗期至收獲期均可發生，可用40%杜邦福星6000～8000倍液、20%粉銹寧乳油1000倍液或50%加瑞農600倍液等噴霧防治。病毒病由蚜蟲、葉甲傳毒，加強田間管理，及時防治蚜蟲、葉甲是預防病毒病的重要方法。發病初期可用20%病毒A500倍液、病毒K1000倍液、病毒靈500倍液噴霧防治，隔7～10天用1次，連續防治3次。蔓枯病可危害葉片、莖蔓和果實，主要的病癥是莖蔓病斑部位有琥珀色樹脂狀膠質物溢出，此病應通過輪作、選用抗病品種、采用配方施肥技術，施用充分腐熟有機肥來預防。發病初期可用40%杜邦福星8000倍液、36%甲基硫菌靈400倍液或47%加瑞農700倍液噴灑。疫病可危害莖、葉、果，染病初為水漬狀，然后軟腐，并在病部生出白色霉狀物。發病初可用72%杜邦克露800倍液、58%甲霜靈錳鋅500倍液、69%安克錳鋅1000倍液噴灑。
板栗南瓜的主要蟲害有：蚜蟲、薊馬、茶黃螨、瓜螟等，蚜蟲和薊馬可選用10%吡蟲啉2000倍液、1%殺蟲素3000倍液或20%康福多4000倍液防治。茶黃螨可選用73%克螨特2000倍液、5%卡死克1000倍液，或1%殺蟲素3000倍液防治。瓜螟可選用5%抑太保1000倍液、或48%樂斯本800倍液，或5%卡死克1000倍液進行防治。
