貯藏用的番茄采收前2天不宜灌水，防止果實吸水膨脹和果皮產生裂痕，從而導致微生物感染和果實腐爛變質。應在早晨或傍晚無露水時采摘，采摘時輕拿輕放，避免造成傷口。包裝容器不宜過大，以免上面的果實將下面的壓傷。采收后，應放在陰涼通風處散熱，或放在冷庫內預冷到13℃，然后挑選分級入庫貯藏，成熟度不同的果實要分別存放，便于管理。主要貯藏方法：
1、塑料帳氣調貯藏法。將裝好的番茄堆碼在窖或通風庫中，用塑料薄膜將碼好的垛套上、封住口成為塑料帳。利用番茄本身的呼吸作用使塑料帳內的氧氣逐漸減少，而二氧化碳逐漸增加，以此來減弱番茄的呼吸作用，延長貯藏期。在貯藏期間，每隔2～3天將塑料帳揭開，擦干帳壁上的小水滴，15分鐘全重新套上，封住口，以補充帳內新鮮空氣，排除帳內過多的二氧化碳，避免番茄腐爛。每隔10～15天翻垛檢查1次，挑出病果。用此法可貯藏1個多月。
2、硅窗氣調貯藏法。薄膜越薄其透氣性越好。試驗結果表明：在其他貯藏條件相同的情況下，使用0.08毫米厚的硅窗，帳內氧的含量將控制在6%左右，二氧化碳在4%左右，效果較好。
番茄采用硅窗氣調貯藏時，要求硅窗面積的太小與品種的呼吸強度、溫度高低成正比。在固定容積的貯藏帳內，隨著貯藏量的增多或減少，硅窗面積也需作相應的擴大或縮小。一般有效體積為4立方米的塑料薄膜帳，貯藏550千克需要開0.45平方米的硅窗。
3、薄膜袋貯藏法。將青番茄輕輕裝入厚度為0.04毫米的聚乙烯薄膜袋（食品袋）中，一般每袋裝5千克，裝后隨即扎緊袋口，放在陰涼處。貯藏初期，每膈2～3天，在清晨或傍晚，將袋口打開15分鐘，排出番茄呼吸產生的二氧化碳，補入新鮮空氣，同時將袋壁上的小水珠擦干，然后再扎好密封。貯藏1～2周后，番茄逐漸轉紅。如需繼續貯藏，則應減少袋內番茄的數量，只平放1～2層，以免相互壓傷。番茄紅熟后，將袋口散開。
采用此法時，還可用嘴向袋內吹氣，以增加二氧化碳的濃度，抑制果實的呼吸。另外，在袋口插入一根兩端開通的竹管，固定扎緊后，可使袋口氣體與外界空氣自動調節，不需經常打開袋口進行通風透氣。
4、吸附劑貯藏法。
方法（1）：把沸石、膨潤土、活性炭、氫氧化鈣按①50:50:0:0；②0:50:50:0；③35:30:35:0；④0:45:45:10的比例配制成不同組成的復合保鮮劑，在其中一種保鮮劑中取10克，裝入一透氣的小袋內，再把小袋放在盛有4千克番茄的容器中。在20℃的溫度下封存，容器內的番茄14天內顏色不轉變，21天內無霉菌生長。可使番茄的貯藏期延長3倍左右。
方法（2）：將30份佛石、20份活性炭、30份硫酸亞鐵、30份氫氧化鈣和1份水混合配成復合保鮮劑。將此混合物稱10克裝入一內襯有多孔聚乙烯薄膜的小紙袋內，并用0.5克水將紙潤濕，然后與番茄一起封裝在一個大聚乙烯袋中。在一定溫度下貯藏60天，番茄顏色不變。
5、防腐膜貯藏法。涂料的配制：蜜蠟10份，酪朊2份，蔗糖脂肪酸酯1份，經充分棍合制成一種乳濁狀涂料。用保鮮涂料涂于番茄梗部形成防腐膜，可有效地控制番茄的呼吸強度，達到防腐保鮮，延遲成熟的目的。
1、塑料帳氣調貯藏法。將裝好的番茄堆碼在窖或通風庫中，用塑料薄膜將碼好的垛套上、封住口成為塑料帳。利用番茄本身的呼吸作用使塑料帳內的氧氣逐漸減少，而二氧化碳逐漸增加，以此來減弱番茄的呼吸作用，延長貯藏期。在貯藏期間，每隔2～3天將塑料帳揭開，擦干帳壁上的小水滴，15分鐘全重新套上，封住口，以補充帳內新鮮空氣，排除帳內過多的二氧化碳，避免番茄腐爛。每隔10～15天翻垛檢查1次，挑出病果。用此法可貯藏1個多月。
2、硅窗氣調貯藏法。薄膜越薄其透氣性越好。試驗結果表明：在其他貯藏條件相同的情況下，使用0.08毫米厚的硅窗，帳內氧的含量將控制在6%左右，二氧化碳在4%左右，效果較好。
番茄采用硅窗氣調貯藏時，要求硅窗面積的太小與品種的呼吸強度、溫度高低成正比。在固定容積的貯藏帳內，隨著貯藏量的增多或減少，硅窗面積也需作相應的擴大或縮小。一般有效體積為4立方米的塑料薄膜帳，貯藏550千克需要開0.45平方米的硅窗。
3、薄膜袋貯藏法。將青番茄輕輕裝入厚度為0.04毫米的聚乙烯薄膜袋（食品袋）中，一般每袋裝5千克，裝后隨即扎緊袋口，放在陰涼處。貯藏初期，每膈2～3天，在清晨或傍晚，將袋口打開15分鐘，排出番茄呼吸產生的二氧化碳，補入新鮮空氣，同時將袋壁上的小水珠擦干，然后再扎好密封。貯藏1～2周后，番茄逐漸轉紅。如需繼續貯藏，則應減少袋內番茄的數量，只平放1～2層，以免相互壓傷。番茄紅熟后，將袋口散開。
采用此法時，還可用嘴向袋內吹氣，以增加二氧化碳的濃度，抑制果實的呼吸。另外，在袋口插入一根兩端開通的竹管，固定扎緊后，可使袋口氣體與外界空氣自動調節，不需經常打開袋口進行通風透氣。
4、吸附劑貯藏法。
方法（1）：把沸石、膨潤土、活性炭、氫氧化鈣按①50:50:0:0；②0:50:50:0；③35:30:35:0；④0:45:45:10的比例配制成不同組成的復合保鮮劑，在其中一種保鮮劑中取10克，裝入一透氣的小袋內，再把小袋放在盛有4千克番茄的容器中。在20℃的溫度下封存，容器內的番茄14天內顏色不轉變，21天內無霉菌生長。可使番茄的貯藏期延長3倍左右。
方法（2）：將30份佛石、20份活性炭、30份硫酸亞鐵、30份氫氧化鈣和1份水混合配成復合保鮮劑。將此混合物稱10克裝入一內襯有多孔聚乙烯薄膜的小紙袋內，并用0.5克水將紙潤濕，然后與番茄一起封裝在一個大聚乙烯袋中。在一定溫度下貯藏60天，番茄顏色不變。
5、防腐膜貯藏法。涂料的配制：蜜蠟10份，酪朊2份，蔗糖脂肪酸酯1份，經充分棍合制成一種乳濁狀涂料。用保鮮涂料涂于番茄梗部形成防腐膜，可有效地控制番茄的呼吸強度，達到防腐保鮮，延遲成熟的目的。
