種鴨群中公母鴨的配比，對種蛋的受精率起著決定性作用。公鴨留得過多，不但經常爭奪配偶、互相騷擾，影響公鴨精力，導致配種力降低，還大量消耗飼料。公母鴨的比例受品種、年齡、季節、飼養管理和配種方法等因素的影響。一般來說，蛋用公鴨比肉用公鴨配種力強些，母鴨的比例可大些；年輕公鴨比老年公鴨配種力強些，母鴨比例可大些；公鴨在春季配種力強些，母鴨比例可比其他季節大些；公鴨營養狀況好或大群配種時，母鴨的比例同樣可大些。
一般情況下，公母鴨適宜的配偶比例是，蛋用品種為1∶20～1∶25，兼用品種為1∶6～1∶10。在實踐中，還應經常觀察配種情況，如公鴨互相爭奪配偶，影響交配，表明公鴨過多，應適當減少；如公鴨追逐母鴨配種而無互相爭奪現象，表明公鴨數量適當；如母鴨追逐公鴨，則表明公鴨不足或性欲不旺，應及時補足。
在種蛋孵化前，還應對種蛋進行受精率檢驗，以便糾正不恰當的配偶比例。方法是，隨機抽取10個蛋，將受檢的鴨蛋打開，觀察附在蛋黃表面的胚珠情況，胚珠為一圓形白點的，屬無精蛋；胚珠較大，內層透明而邊緣混濁的是受精蛋。優良的種蛋受精率應達到95%以上。
飼養蛋鴨的目的是獲得商品蛋，實踐證明，蛋鴨的性欲越強，產蛋就越多。在商品蛋鴨中保留一定數量的公鴨，可起到誘導蛋鴨發“性”，促進蛋鴨性機能活動的作用，從而提高產蛋量。蛋鴨群中以保留2%～5%的公鴨為宜，產蛋量可比不保留公鴨提高10%～12%以上。
